Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3371F7CQW8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3371F7CQW8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3371F7CQW8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3371F7CQW8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3371F7CQW8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3371F7CQW8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3371F7CQW8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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