Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm10722F6VLK5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm10722F6VLK5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10722F6VLK5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10722F6VLK5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10722F6VLK5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10722F6VLK5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10722F6VLK5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10722F6VLK5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10722F6VLK5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm10722F6VLK5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms