Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BC067074F6RXI4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BC067074F6RXI4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BC067074F6RXI4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms