Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm340F6RGI3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm340F6RGI3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms