Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm9887F6RFI0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm9887F6RFI0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm9887F6RFI0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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