Protein–RNA interactions for Protein: F6R5P4

Ccl17, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl17F6R5P4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl17F6R5P4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl17F6R5P4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms