Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc7bE9Q9Y3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms