Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc74aE9Q9U8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc74aE9Q9U8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms