Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3hdm1E9Q9Q2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
R3hdm1E9Q9Q2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3hdm1E9Q9Q2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3hdm1E9Q9Q2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
R3hdm1E9Q9Q2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.9 ms