Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TrdnE9Q9K5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms