Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Gm5407E9Q7Q1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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Gm5407E9Q7Q1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Gm5407E9Q7Q1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm5407E9Q7Q1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Gm5407E9Q7Q1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Gm5407E9Q7Q1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Gm5407E9Q7Q1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Gm5407E9Q7Q1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Gm5407E9Q7Q1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm5407E9Q7Q1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5407E9Q7Q1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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