Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Urb2E9Q7L1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC33.8■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Urb2E9Q7L1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Urb2E9Q7L1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Urb2E9Q7L1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Urb2E9Q7L1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Urb2E9Q7L1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Urb2E9Q7L1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms