Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp31E9Q6Y8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp31E9Q6Y8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp31E9Q6Y8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms