Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Simc1E9Q6E9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Simc1E9Q6E9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Simc1E9Q6E9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms