Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700024B05RikE9Q6D7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700024B05RikE9Q6D7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms