Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FancfE9Q5Z5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FancfE9Q5Z5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FancfE9Q5Z5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms