Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ythdc1E9Q5K9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ythdc1E9Q5K9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ythdc1E9Q5K9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms