Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb9E9Q5G2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb9E9Q5G2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb9E9Q5G2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms