Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DspE9Q557 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DspE9Q557 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DspE9Q557 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DspE9Q557 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DspE9Q557 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DspE9Q557 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DspE9Q557 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DspE9Q557 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DspE9Q557 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DspE9Q557 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DspE9Q557 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DspE9Q557 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DspE9Q557 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DspE9Q557 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DspE9Q557 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DspE9Q557 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DspE9Q557 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DspE9Q557 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DspE9Q557 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms