Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup153E9Q3G8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup153E9Q3G8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup153E9Q3G8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup153E9Q3G8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup153E9Q3G8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup153E9Q3G8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup153E9Q3G8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup153E9Q3G8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup153E9Q3G8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nup153E9Q3G8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms