Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc171E9Q1U1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc171E9Q1U1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc171E9Q1U1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc171E9Q1U1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
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