Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdr1E9Q0B4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdr1E9Q0B4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdr1E9Q0B4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms