Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm9972E9Q053 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms