Protein–RNA interactions for Protein: E9PYW5

Vmn1r174, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r174E9PYW5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r174E9PYW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r174E9PYW5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms