Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30bE9PVL6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim30bE9PVL6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms