Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc17E9PVB5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc17E9PVB5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc17E9PVB5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms