Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc175E9PVB3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc175E9PVB3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc175E9PVB3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms