Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim5E9PV98 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim5E9PV98 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms