Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca3bE9PUL3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca3bE9PUL3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clca3bE9PUL3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms