Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Cngb1E1AZ71 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cngb1E1AZ71 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cngb1E1AZ71 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cngb1E1AZ71 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms