Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc78D3Z5T1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc78D3Z5T1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc78D3Z5T1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms