Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm10110D3Z5M2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10110D3Z5M2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10110D3Z5M2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms