Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5934D3Z4U6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5934D3Z4U6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5934D3Z4U6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.7 ms