Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccnb1ip1D3Z3K2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccnb1ip1D3Z3K2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms