Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pnldc1B2RXZ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms