Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cspp1B2RX88 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cspp1B2RX88 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cspp1B2RX88 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms