Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700018F24RikB2RW27 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018F24RikB2RW27 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018F24RikB2RW27 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms