Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usf3B2RUQ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usf3B2RUQ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms