Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Prrt4B2RU40 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrt4B2RU40 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrt4B2RU40 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms