Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc22a28B2RT89 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms