Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7aB2RT54 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7aB2RT54 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7aB2RT54 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7aB2RT54 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7aB2RT54 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7aB2RT54 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7aB2RT54 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7aB2RT54 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7aB2RT54 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7aB2RT54 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7aB2RT54 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7aB2RT54 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apol7aB2RT54 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apol7aB2RT54 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms