Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ythdc2B2RR83 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ythdc2B2RR83 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ythdc2B2RR83 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ythdc2B2RR83 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ythdc2B2RR83 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ythdc2B2RR83 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ythdc2B2RR83 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ythdc2B2RR83 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms