Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap221A9Q751 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap221A9Q751 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms