Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Skint7A7XV04 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skint7A7XV04 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint7A7XV04 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms