Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint2A7XUX6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skint2A7XUX6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skint2A7XUX6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.1 ms