Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3173A6NAS3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3173A6NAS3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3173A6NAS3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3173A6NAS3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3173A6NAS3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3173A6NAS3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3173A6NAS3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3173A6NAS3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3173A6NAS3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3173A6NAS3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3173A6NAS3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3173A6NAS3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms