Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc38A3KMP2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms