Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp8b5A3FIN4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp8b5A3FIN4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp8b5A3FIN4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms