Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1jA2BFR3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1jA2BFR3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms