Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samt1A2BED8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms